ไคบะ​ เซโตะ​ ทำการสร้างดูเอลดิสต์ขึ้นมาใหม่​ ในตอนแรกจัดให้มีการดูเอลกับภาพโฮโลแกรม​ แต่ค้นพบว่ามันไม่สำเร็จจึงติดต่อ​ จิน​ เพื่อนสนิทของตนให้มาช่วยทดสอบดูเอลดิสต์เพื่อใช้ในศึกดูเอลคิงดอม​ แต่ไคบะนั้นไม่รู้ว่าในตอนนั้น​จินคนปัจจุบัน​ที่เขารู้จักเกิดอุบัติเหตุ​และเสียชีวิต​ไปก่อนหน้านี้​แล้ว​ ทำให้ร่างของจินคนปัจจุบัน​นั้นถูกแทนที่ด้วยวิญญาณ​ของนายทวารหรือจินในอดีต​นั่นเอง​ เมื่อดูเอลดิสต์ประสบผลสำเร็จ​ ไคบะได้เชิญให้จินเข้าร่วมศึกดูเอลคิงดอมโดยกำหนดให้จินอยู่ในระดับ LV.8 แต่จินปฏิเสธ

ไคบะมีบทบาทแค่ตอนที่ออกมาสั่งให้จินดูแลไคบะ​ ครอ​ปเปอร์​เรชั่นแทนตนเองเท่านั้น

ไคบะ​ ได้ดูการดูเอลของจินกับมุโต้​ ยูกิ​หรืออาเทม​ เมื่อจินพ่ายแพ้​ ไคบะจึงรับรู้แล้วว่าจินคนนี้ไม่ใช่จินที่ไคบะรู้จัก​ และจินเองก็ได้เฉลยว่าแท้จริงแล้วนั้นเจ้าของร่างได้ตายไปแล้วก่อนหน้านี้​หลังจาก​นั้นก็ทำการอัตวินิบาตกรรม​เหมือนกับโกซาบุโร่​โดยการกระโดดจากหน้าต่างบนห้องทำงานของไคบะ​ แต่ไคบะสามารถ​ช่วยจินเอาไว้ได้​ ไคบะพูดบางอย่าง​กับจิน​ ทำให้วิญญาณ​ของจินยุคฟาโรห์​นั้นสลายหายไป​และจินคนปัจจุบัน​ก็ฟื้นกลับมา

ไคบะพัฒนา​ระบบของไคบะครอ​ปเปอร์​เ​ร​ชั่นจนกลายเป็น​บริษัท​เกมส์ที่โด่งดังและเป็นกำลังหลักทรัพย์​ใหญ่ของตลาดโลก​ โดยทำงานร่วมกันกับเปกาซัส​ มีโมคุบะและจินคอยช่วยเหลือ​ในงานวิจัยต่างๆ​ และบริษัท​ไคบะ​ ครอ​ปเปอร์เรชั่นเองก็ได้รับเด็กฝึกเข้ามา​คือ​ เคียวเซ็ทสึ​ ซึ่งไคบะเป็นผู้เลือกด้วยตนเอง